Killing Eve racconta la storia di due donne, collegate da una reciproca ossessione e un atto brutale: Eve, un agente MI6, e Villanelle, la bellissima, psicopatica assassina che la prima ha il compito di trovare.
La stagione 2 inizia 30 secondi dopo la fine dell'ultima episodio della prima stagione; Eve annaspa e Villanelle è scomparsa. Eve non ha idea se la donna che ha accoltellato è viva oppure no, e ora entrambe hanno gravi problemi. Eve deve trovare Villanelle prima che altri lo facciano, ma sfortunatamente lei non è l'unica che la sta cercando.