La stagione 2 vede Supergirl, Kara Zor-El (Melissa Benoist), fare coppia con suo cugino Superman (Tyler Hoechlin). Kara e James (Mehcad Brooks) decidono che stanno meglio come amici, lasciando spazio a Mon-El (Chris Wood), l'alieno misterioso trovato nell'astronave caduta nella stagione 1, che si apre verso la Ragazza d'acciaio. Da un'altra parte, con l'aiuto di Maggie (Floriana Lima), Alex (Chyler Lee) accetta la sua sessualità; allo stesso momento, Lena Luthor (Katie McGrath) ripensa alle sue fedeltà familiari. L'episodio 8 inizia con un crossover con le serie tv sorelle di Th CW: Arrow, The Flash e DC's Legends of Tomorrow.
