Nella terza stagione della serie, Kara (Melissa Benoist) è distrutta dalla perdita del suo fidanzato, Mon-El (Chris Wood), dopo che è stato costretto a lasciare la Terra. Per evitare di fare i conti con le sue emozioni, Kara sceglie di concentrarsi sul suo alter ego Supergirl e dovrà fronteggiare nuove minacce contro National City. Nel mentre, J'onn (David Harewood) scopre che suo padre è ancora vivo. In più, Alex (Chyler Leigh) e Kara senza saperlo diventando amici con un sopravvissuto kryptoniano.
